A estrutura administrativa do supletivo é regida pelo regimento interno da Associação Educacional e Tecnológica de Santa Catarina, entidade mantenedora.
Sua direção é constituída:
Pelo Diretor Geral do ITA;
Pelos Coordenadores Gerais;
O departamento de ensino é a unidade responsável pela organização didático-pedagógica das disciplinas afetas aos cursos técnicos, ensino à distância e profissionalizantes, e pela distribuição dos encargos de pessoal docente.
A Secretaria é o órgão encarregado dos serviços administrativos do ITA.
Os demais serviços auxiliares como Departamento de RH, Tesouraria, Manutenção e Serviços gerais ficarão a cargo da entidade mantenedora que fixará as regras quanto às suas atribuições e funcionamento.